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細胞STR分型
細胞STR分型/細胞系STR檢測/小鼠細胞系STR分型/猴細胞STR分型

      在過去的45年里，雖然科研工作者使用各種各樣的傳統方法來鑒定細胞，但細胞交叉污染的問題卻有增無減。據估計，國外15-25%的研究論文因為使用了被錯誤辨識和交叉污染的細胞而導致錯誤的結論。這造成數以百萬美元的研究經費的浪費，并產生了大量的無效數據。而在國內，這一比率將會更大。
      2007年NIH針對這一情況發布了通知，強烈建議在使用培養細胞的時候進行鑒定（authentication）。2008年底，專家提議ATCC致力于人源細胞系的鑒定工作，并制定鑒定的標準程序。近年來，大量研究表明STR基因分型方法是進行細胞交叉污染和性質鑒定的最有效和準確的方法之一。ATCC細胞庫STR分型數據庫中提供了各細胞株的數據供比對。

細胞STR鑒定的優勢及應用：

      高度豐富信息，同時分析超過多個STR基因座，可以準確判斷細胞交叉污染和細胞類型。
      高靈敏度，可以檢測最低至0.1ng DNA（約15個二倍體基因組），微量污染也可檢測。
      ATCC細胞庫或其他細胞庫若有有相應細胞STR分型數據，可與之比對得出所檢細胞系的名稱。
科研成果能夠得到重復確認，對于證實科學發現是十分重要的。如果數據無法重復，那么這個結果能否得到業界的認可并為研究人員所追隨就是個很大的疑問了。很多生物醫藥的研究都采用培養細胞來進行，這些細胞可能是從各大細胞庫得來，也可能是受贈于其它研究人員。據估計，15-20%的時間里，實驗中所使用的細胞已經不是原來的細胞系，或者與其它細胞系發生了交叉污染(1-3)。ATCC以及其它細胞庫（Coriell Institute for Medical Research, European Collection of Cell Cultures (ECACC), Deutsche Sammlung von Mikrorganismen and Zellkulturen (DSMZ), Japanese Collection of Research Resources）都收到過提交的“錯誤”的細胞系，盡管提交者把細胞系提交到上述機構之前，還經過了檢驗。然而，最終證實這些細胞系還是鑒別錯了。此外，干細胞也可能被污染，作為干細胞賴以增殖的哺育細胞層，小鼠細胞很容易污染到干細胞中。顯然，細胞系遭到污染、特征鑒別錯誤，將會極大地威脅著基于這些細胞而發表的論文的質量和研究發現的正確性。因此，可根據細胞系的STR分型結果，對細胞的株系進行確認并對細胞的生長狀態（是否存在交叉污染）進行監測。

細胞STR鑒定　　

背景介紹：
應用于生物醫學研究領域的哺乳動物細胞被錯誤鑒定和交叉污染的問題，一直是一個普遍存在的突出問題。據統計，國外實驗室有20%左右的細胞株被錯誤鑒定和交叉污染，NIH和ATCC近兩年都對此發出呼吁，要求研究者對細胞進行鑒定。近年來，大量研究表明STR基因分型方法是進行細胞交叉污染和性質鑒定的最有效和準確的方法之一，STR基因分型應用于細胞鑒定已被ATCC等機構強烈推薦。閱微基因作為ATCC標準委員會成員，在國內率先推出了細胞STR鑒定服務并與多家研究機構、細胞中心、生產廠商等建立長期合作關系。

• 高度豐富信息：同時分析多個STR基因座，可以準確的判斷交叉污染和細胞類型。
• 高度靈敏：可以檢測最低0.1ng DNA（約15個二倍體基因組），微量樣本即可滿足需求，并且可以檢測到早期污染。
• 高通量和系統化平臺：采用自動化分析系統可大量檢測及數據分析，結果更加準確、客觀。

服務項目：
１．人類細胞16個基因座檢測：
    所選用的基因座跟ATCC和JCRB細胞庫中的基因座完全一致，可方便與權威數據庫進行比對。位點如下：

2.人類細胞20個基因座檢測：
    是目前基因座最多的檢測服務，兼容以上各組數據之外更添加4個高度多態性位點——D19S433、D6S1043、D12S391和D2S1338，具有更高的準確性。

3．小鼠細胞檢測
    分析小鼠基因組中8個高度多態性位：D1Mit159.1、D2Mit395.1、D4Mit170.1、D7Mit40、D11Mit4、D15Mit16、D17Mit51.1和Jarid1。

４．人鼠細胞交叉污染檢測
國內首創技術，采用人鼠復合擴增體系檢測人類細胞中的小鼠細胞污染，主要應用在干細胞研究領域。同時可以用于判斷人鼠細胞混淆的情況。

送樣要求：
細胞懸液（細胞數≥106 個）或基因組DNA（≥20μl，濃度≥50ng/μl）。

提供結果：
STR分型的圖譜和檢測結果的書面報告。

成功案例：
某三甲醫院委托一株細胞鑒定是否存在交叉污染現象，本公司采用16個基因座系統檢測（圖1）。

圖1　一株細胞的STR鑒定圖譜
結果顯示：該細胞在D13S317、D16S539、TH01和D8S1179共4個基因座出現三等位基因現象，說明有其他人類細胞交叉污染。